28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0243 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0243  head completion protein  100 
 
 
155 aa  313  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  54.79 
 
 
151 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  54.79 
 
 
163 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  41.33 
 
 
153 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  43.17 
 
 
153 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0583  putative phage head completeion protein  35.42 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  35 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05029  hypothetical protein  33.56 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  34.03 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1287  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  35.62 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  29.58 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  28.57 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0725  hypothetical protein  24.83 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  27.08 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  34.25 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  33.1 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  28.06 
 
 
156 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  30.69 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1031  probable head completion/stabilization protein  25 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0699  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  27.27 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  28.78 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  26.03 
 
 
158 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  28.06 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  38.18 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  21.15 
 
 
175 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  31 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  25.55 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>