More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2975 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  100 
 
 		 88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  86.36 
 
 		 88 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  86.36 
 
 		 88 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  86.36 
 
 		 88 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  79.55 
 
 		 88 aa  153  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  77.27 
 
 		 88 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  71.59 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  69.32 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  69.32 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  70.45 
 
 		 88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  68.18 
 
 		 88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  64.77 
 
 		 88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  71.26 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  71.26 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  67.82 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  60.47 
 
 		 492 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  59.77 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  59.26 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  59.77 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  56.32 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  56.32 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  57.95 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  57.95 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  56.32 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  57.95 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  56.98 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 370 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  55.17 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  52.87 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  57.14 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0137  transposase IS3/IS911  55.42 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1300  transposase IS3/IS911  55.42 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.66583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1483  transposase IS3/IS911  55.42 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  55.42 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  53.41 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  52.38 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  51.19 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  51.19 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  51.19 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  51.19 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  55.95 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>