More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0209 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5181  ATP-dependent chaperone ClpB  46.54 
 
 		 854 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  45.17 
 
 		 865 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  44.7 
 
 		 874 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0974  ATPase  44.1 
 
 		 869 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.81 
 
 		 869 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  46.05 
 
 		 854 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  45.42 
 
 		 864 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  44.88 
 
 		 879 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  42.45 
 
 		 859 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  48.01 
 
 		 866 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  42.2 
 
 		 894 aa  714    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  47.32 
 
 		 854 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  46.18 
 
 		 824 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  41.06 
 
 		 866 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  47.05 
 
 		 858 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  47.05 
 
 		 858 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  47.18 
 
 		 854 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  46.37 
 
 		 865 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.34 
 
 		 863 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  41.55 
 
 		 872 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  41.43 
 
 		 863 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1574  ATPase  50 
 
 		 931 aa  868    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.513125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  43.93 
 
 		 874 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  45.68 
 
 		 861 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  45.36 
 
 		 891 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  42.2 
 
 		 873 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  42.14 
 
 		 876 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  41.82 
 
 		 872 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  41.06 
 
 		 866 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0885  ATPase  45.01 
 
 		 866 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  46.1 
 
 		 867 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  41.55 
 
 		 872 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  39.48 
 
 		 862 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  45.66 
 
 		 941 aa  845    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  40.31 
 
 		 862 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  46.98 
 
 		 924 aa  862    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  38.39 
 
 		 865 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27741  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.38 
 
 		 926 aa  892    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0209  ATPase  100 
 
 		 918 aa  1832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0637  ATPase  48.31 
 
 		 895 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0120026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  39.85 
 
 		 883 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  45.42 
 
 		 869 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  46.16 
 
 		 854 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  40.46 
 
 		 867 aa  648    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  38.35 
 
 		 879 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02271  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  91.39 
 
 		 918 aa  1639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06361  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  40.47 
 
 		 863 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02831  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.21 
 
 		 931 aa  871    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  47.11 
 
 		 866 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0007  ATP-dependent chaperone ClpB  40.97 
 
 		 888 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  40.77 
 
 		 872 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  45.08 
 
 		 879 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  44.16 
 
 		 878 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  44.77 
 
 		 878 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  46.37 
 
 		 865 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  40.97 
 
 		 888 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24612  chaperone, Hsp100 family, ClpB-type  38.47 
 
 		 923 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.311804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  47.5 
 
 		 861 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  39.72 
 
 		 864 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  40.67 
 
 		 893 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  41.07 
 
 		 863 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  48.37 
 
 		 858 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  45.12 
 
 		 891 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  43.93 
 
 		 874 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  40.66 
 
 		 870 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  41.66 
 
 		 905 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  41.3 
 
 		 899 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  41.54 
 
 		 872 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  46.57 
 
 		 861 aa  651    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  46.97 
 
 		 871 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  44.73 
 
 		 878 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  46.97 
 
 		 871 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  46.68 
 
 		 854 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0993  ATPase  44.1 
 
 		 869 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  40.07 
 
 		 863 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.22 
 
 		 920 aa  895    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  48.15 
 
 		 859 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  46.44 
 
 		 887 aa  646    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02361  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  77.17 
 
 		 915 aa  1375    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  42.06 
 
 		 890 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  91.31 
 
 		 920 aa  1679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  46.96 
 
 		 857 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1549  putative ATP-dependent protease (heat shock protein)  45.74 
 
 		 867 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1601  ATP-dependent chaperone ClpB  40.61 
 
 		 864 aa  636    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3639  ATPase  46.6 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1839  ATP-dependent chaperone ClpB  46.31 
 
 		 873 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.92 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  40.2 
 
 		 866 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  44.33 
 
 		 860 aa  634  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  39.25 
 
 		 870 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  39.74 
 
 		 880 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  46.37 
 
 		 864 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  40.2 
 
 		 866 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.03 
 
 		 865 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  46.12 
 
 		 854 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  46.26 
 
 		 870 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  45.1 
 
 		 879 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  45.71 
 
 		 861 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  39.37 
 
 		 859 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  39.25 
 
 		 870 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>