58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1541 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02481  thioesterase  88 
 
 
150 aa  281  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01911  thioesterase  50.34 
 
 
151 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  46.15 
 
 
151 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  45.32 
 
 
149 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2116  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  42.96 
 
 
150 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  42.25 
 
 
150 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  41.55 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02021  thioesterase  39.31 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0211795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
138 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
138 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  31.58 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0457  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4064  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
138 aa  84.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000508078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0111  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.08 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.08 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  22.77 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  27.37 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  20.31 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03521  thioesterase  30.86 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.18 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  23.64 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.78 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  20.18 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.88 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  22.61 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  21.1 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  20.18 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  24.75 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0562  thioesterase family protein  29.47 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  24.75 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  21.5 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  30.85 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  25.51 
 
 
139 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>