220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1173 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  98.95 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  51.52 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  50.72 
 
 		 282 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  44.8 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  46.26 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  46.56 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  44.75 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  45.98 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  43.46 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  41.01 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  40.65 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  40.16 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  36.4 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  36.19 
 
 		 305 aa  175  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  36.43 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  31.85 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25881  hypothetical protein  46.43 
 
 		 129 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25841  hypothetical protein  52.5 
 
 		 90 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  29.94 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  25.95 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  27.91 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  23.14 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  25.56 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  27.11 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  24.53 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  24.91 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  25.44 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  24.05 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  27.24 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  23.13 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  25.33 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  26.73 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  24.15 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  24.64 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  24.23 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  22.77 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  24.63 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  24.63 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  24.79 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  24.79 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  25.43 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  24.9 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  24.24 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  27.33 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  24.79 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  25.21 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  25.21 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  27.12 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  21.22 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  25 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  24.37 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  24.06 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  25.21 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  28.39 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  23.5 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  32.03 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  23.13 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01070  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  22.59 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  24.22 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  25.95 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39942  predicted protein  24.5 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  24.22 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  26.09 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  24.49 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  22.44 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  36.36 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  36.27 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  22.6 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  25.18 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  24.88 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  25.49 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  28.89 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>