More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0295 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  100 
 
 		 485 aa  984    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  77.66 
 
 		 483 aa  771    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  75.16 
 
 		 494 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  77 
 
 		 597 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  66.18 
 
 		 594 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  77.68 
 
 		 580 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  77.22 
 
 		 596 aa  758    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  75.53 
 
 		 596 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  99.18 
 
 		 485 aa  977    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  76.47 
 
 		 605 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  77.22 
 
 		 596 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  65.42 
 
 		 601 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  64.11 
 
 		 589 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  63.03 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  63.03 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  64.09 
 
 		 590 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  63.18 
 
 		 587 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  63.35 
 
 		 600 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 585 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 581 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  48.43 
 
 		 588 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.57 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  47.97 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.68 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  46.6 
 
 		 580 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  48.01 
 
 		 587 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  46.82 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  46.81 
 
 		 577 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  48.84 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  46.96 
 
 		 585 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 580 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  46.75 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  46.54 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  46.96 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  46.84 
 
 		 585 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  45.99 
 
 		 582 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  46.84 
 
 		 582 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  44.65 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  46.43 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.8 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 580 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 478 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.64 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  47.77 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  44.81 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  44.42 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  44.3 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  47.15 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  45.07 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  45.49 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 480 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  45.73 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  46.11 
 
 		 585 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  42.05 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  43.62 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  44.07 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  46.38 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  43.16 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  45.38 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  44.97 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.77 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  44.61 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  44.59 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  46.17 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  43.49 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  44.7 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  44.94 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  44.51 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  45.3 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  43.56 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  45.51 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  45.3 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 476 aa  392  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  42.18 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  43.86 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  46.11 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  43.51 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  42.09 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  42.98 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  41.1 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  43.87 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  42.49 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  44.8 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>