45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68309 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_68309  predicted protein  100 
 
 
927 aa  1876    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00286141 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10010  decapping enzyme Dcp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12420)  43.28 
 
 
825 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.43911 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  37.24 
 
 
888 aa  166  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46543  predicted protein  30.08 
 
 
532 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5662  predicted protein  28.33 
 
 
305 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.059754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
139 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
351 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
140 aa  48.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
141 aa  48.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
229 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
341 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
322 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
140 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 
140 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
229 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.68 
 
 
140 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.04 
 
 
315 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
194 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
158 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 
140 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  28.91 
 
 
208 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  43.1 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.75 
 
 
187 aa  45.8  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  30.69 
 
 
140 aa  45.8  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
153 aa  45.8  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.69 
 
 
140 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  50 
 
 
301 aa  45.8  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
163 aa  45.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
163 aa  45.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  34.26 
 
 
140 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
169 aa  45.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
155 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
140 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  44.3  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
183 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>