More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57474 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  100 
 
 
90 aa  188  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01950  mitochondrial ribosomal protein s19, putative  52.75 
 
 
91 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  53.85 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  50 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  48.72 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  49.35 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  50 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  46.75 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  46.15 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  46.75 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  47.44 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  46.05 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  43.9 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  47.44 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  46.15 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  48.72 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  44.87 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  47.44 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  47.44 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  43.59 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>