38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50236 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  100 
 
 		 267 aa  554  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01860  conserved hypothetical protein  36.97 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285542  normal  0.653902 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02570  mitochondrion protein, putative  30.98 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 218 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.545731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0237  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.4 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34681  predicted protein  24.5 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0414055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  28.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.88 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.4 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.23 
 
 		 381 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.49 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.05 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.13 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  24.1 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  30.23 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.14 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  20.61 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  30.23 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.23 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  22.22 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.59 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.89 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.73 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 307 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>