23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30650 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30650  Protein necessary for structural stability of L-A double-stranded RNA-containing particles  100 
 
 		 353 aa  727    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0154701  normal  0.395285 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00998  PfkB family carbohydrate kinase (Mak32), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12750)  31.48 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269478  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01919  pfkB family carbohydrate kinase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_4G09500)  26.67 
 
 		 467 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0083327 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00450  expressed protein  28.28 
 
 		 436 aa  90.9  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.98204  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02840  host-pathogen interaction-related protein, putative  27.59 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.674876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  32.58 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  25 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  37.7 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.77 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  33.02 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  27.69 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  30.39 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.52 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0338  rfaE bifunctional protein  29.01 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  26.53 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2339  bifunctional ADP-heptose synthase  26.89 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.16445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>