17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54789 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  100 
 
 		 1205 aa  2465    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  39.79 
 
 		 676 aa  231  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  29.12 
 
 		 835 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  34.48 
 
 		 841 aa  197  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  26.26 
 
 		 817 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  27.76 
 
 		 766 aa  132  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  24.48 
 
 		 755 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  24.18 
 
 		 732 aa  123  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  25.5 
 
 		 736 aa  122  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  26.59 
 
 		 696 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  26.93 
 
 		 551 aa  111  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  22.87 
 
 		 717 aa  95.5  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  22.36 
 
 		 805 aa  94.7  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  24.55 
 
 		 697 aa  89.7  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  22.67 
 
 		 785 aa  86.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  31.97 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  23.08 
 
 		 952 aa  51.6  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>