More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11799 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11799  predicted protein  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  60.53 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0487  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  57.5 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0897  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  57.5 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_002978  WD0135  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0546  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  58.97 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  70.15 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  59.74 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  55.42 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  55.56 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3034  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  57.5 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 85 aa  87.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  63.77 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  60.26 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  55 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  55 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>