20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1469 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  78.79 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42.65 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42.65 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  44.68 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  40.38 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  36.73 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0150  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>