14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4582 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  40.92 
 
 
397 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  32.16 
 
 
380 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  30.77 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  30.51 
 
 
441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  31.6 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  28.62 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  28.47 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  28.25 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  26.15 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  25.8 
 
 
404 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  24.37 
 
 
392 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3169  hypothetical protein  22.27 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  34.18 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.369898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>