19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2490 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3860  hypothetical protein  90.43 
 
 
188 aa  333  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  56.1 
 
 
3027 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  53.33 
 
 
14609 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  46.3 
 
 
830 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  55.81 
 
 
1394 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  48 
 
 
767 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  52.38 
 
 
692 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  59.46 
 
 
1316 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  40.68 
 
 
1831 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  54.29 
 
 
3861 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  51.43 
 
 
3822 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  57.89 
 
 
866 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 
1446 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  32.86 
 
 
1908 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  61.76 
 
 
1487 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1170  hypothetical protein  54.29 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  51.43 
 
 
4009 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 
1188 aa  41.2  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>