16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3860 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  90.43 
 
 		 188 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  53.33 
 
 		 14609 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  44.83 
 
 		 3027 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  52.08 
 
 		 1394 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 830 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  46 
 
 		 767 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1107 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 		 1831 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1316 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  48.84 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 		 1188 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  51.28 
 
 		 692 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  51.43 
 
 		 3861 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  40 
 
 		 1321 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  50 
 
 		 1487 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>