68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3187 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  73.71 
 
 		 213 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  71.22 
 
 		 213 aa  309  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  67.77 
 
 		 217 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  69.35 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  70.35 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  65.88 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  59.41 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  60.89 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  45.45 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  44.83 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  45.28 
 
 		 273 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  45.93 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  46.41 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  46.23 
 
 		 192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  45.32 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  45.81 
 
 		 193 aa  171  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  42.44 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  39.63 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  38.1 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  43.56 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  37.38 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  36.87 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  37.44 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  37.44 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  37.01 
 
 		 154 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  45.07 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  35.38 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  35.38 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  34.95 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  35.05 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  34.21 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  34.86 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  63.49 
 
 		 119 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  63.49 
 
 		 84 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  63.49 
 
 		 84 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  38.46 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  38.46 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  32.48 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  29.52 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  36.64 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  36.64 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  34.85 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  32.89 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  32.54 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  36.19 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  32.89 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  33.93 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  30.05 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  32 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  26.13 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  27.68 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  30.77 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  26.9 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  38.46 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  26.82 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  27.74 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  30 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  31.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  28.91 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  32.03 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  28.04 
 
 		 145 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  30.53 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  25.69 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 811 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  33.77 
 
 		 175 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 1094 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>