299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0379 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  741    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  94.56 
 
 		 359 aa  690    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  77.25 
 
 		 388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  75.93 
 
 		 355 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  60.85 
 
 		 356 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  53.39 
 
 		 361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  53.33 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  48.32 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  47.15 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  45.01 
 
 		 366 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  44.11 
 
 		 387 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  42.99 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  42.69 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 831 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  32.77 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  34.62 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  34.81 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  29.65 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  27.32 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  31.69 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 488 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  32.6 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  30.87 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  28.48 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 338 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  27.95 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  29.07 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  26.75 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  25.55 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  30.36 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  31.43 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  36.15 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  30.28 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  34.36 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  31.62 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  24.51 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  27.78 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1076  homoserine O-acetyltransferase  30.32 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000373874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  48.98 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  29.86 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  28.22 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  35.32 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  30.33 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  30.48 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  31.11 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  33.16 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2550  homoserine O-acetyltransferase  27.75 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  29.46 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  30.19 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  31.82 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  29.46 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  37.98 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  32.32 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  32.41 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  28.05 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1824  homoserine O-acetyltransferase  32.6 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  33.5 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  32.32 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  29.86 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  29.58 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  27.66 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  27.98 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  30.1 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  32.41 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0730  homoserine O-acetyltransferase  28.47 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0067  homoserine O-acetyltransferase  30.3 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  30.93 
 
 		 496 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  28.44 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  28.44 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0727  homoserine O-acetyltransferase  27.72 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  24.92 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1883  homoserine O-acetyltransferase  28.28 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0930  homoserine O-acetyltransferase  31.8 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  34.51 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1879  homoserine O-acetyltransferase  30.89 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1206  homoserine O-acetyltransferase  32.68 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  29.44 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  30.04 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3400  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  29.22 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  28 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  26.91 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3723  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  33.74 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  31.65 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0909  homoserine O-acetyltransferase  32.11 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  27.96 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6242  homoserine O-acetyltransferase  31.89 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0424143  normal  0.823707 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.29 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  33.68 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0820  homoserine O-acetyltransferase  27.97 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.602432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  28.57 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  29.32 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  25.89 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>