65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14021 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1077    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  41.98 
 
 
548 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.65 
 
 
493 aa  153  8e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  32.71 
 
 
267 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  24.81 
 
 
504 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.28 
 
 
494 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  30.36 
 
 
241 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  26.1 
 
 
253 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.74 
 
 
245 aa  97.1  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 
245 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  26.48 
 
 
253 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.64 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  22.68 
 
 
332 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  26.29 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  24.73 
 
 
330 aa  77  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  25.68 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  25.97 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  24.69 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  21.99 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  21.58 
 
 
331 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  21.09 
 
 
329 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  22.47 
 
 
240 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  25.77 
 
 
242 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  25.77 
 
 
242 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 
338 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  23.95 
 
 
254 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
243 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3155  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.83 
 
 
492 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  25.42 
 
 
336 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  26.09 
 
 
241 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  25.74 
 
 
240 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  23.1 
 
 
330 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
243 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.86 
 
 
333 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  20.22 
 
 
324 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  22.03 
 
 
240 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  25.1 
 
 
246 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0658  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.68 
 
 
246 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.64009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  22.4 
 
 
251 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1992  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.91 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  19.13 
 
 
326 aa  50.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  21.53 
 
 
325 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.84 
 
 
328 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0414  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.32 
 
 
484 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  24.71 
 
 
246 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0099  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.46 
 
 
456 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.749054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2499  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.94 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  19.93 
 
 
325 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0177  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase protein  22.92 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  20.66 
 
 
325 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.73 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00420583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22 
 
 
355 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2976  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.08 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 
241 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1770  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  24.49 
 
 
244 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2243  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.164463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0337  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.116008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3380  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00368605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0324  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2041  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
561 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0518  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
561 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  22.5 
 
 
231 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0044  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  20.88 
 
 
459 aa  43.5  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000298582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>