33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  77.99 
 
 
211 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  76.3 
 
 
211 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  77.51 
 
 
211 aa  336  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  80.75 
 
 
219 aa  328  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  80.75 
 
 
219 aa  328  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  76.8 
 
 
214 aa  305  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03421  hypothetical protein  81.29 
 
 
171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0314258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  68.72 
 
 
218 aa  257  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  44.16 
 
 
216 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  43.65 
 
 
216 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  48.25 
 
 
246 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  46.97 
 
 
249 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  46.97 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20551  hypothetical protein  44.37 
 
 
228 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  41.89 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26.53 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26.53 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  25.48 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  24.68 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  27.47 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  26.13 
 
 
267 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  28.22 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.36 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  27.22 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.27 
 
 
746 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  30.88 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.03 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.63 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>