29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  307  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  69.01 
 
 		 170 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  69.01 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  69.23 
 
 		 170 aa  225  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  67.47 
 
 		 170 aa  220  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  80.79 
 
 		 176 aa  213  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  82.43 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  63.53 
 
 		 173 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  61.84 
 
 		 172 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  61.49 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  60.87 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  32.41 
 
 		 342 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.93 
 
 		 338 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  25.36 
 
 		 383 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  31.65 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  30.34 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  34.23 
 
 		 384 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  30.97 
 
 		 343 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  26.28 
 
 		 349 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  27.97 
 
 		 355 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  29.66 
 
 		 355 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  26.92 
 
 		 342 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  30.3 
 
 		 348 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  29.7 
 
 		 348 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  29.7 
 
 		 348 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  29.7 
 
 		 348 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  29.7 
 
 		 348 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  29.36 
 
 		 389 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  31.72 
 
 		 351 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>