More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_rrsVIMSS1309398 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 		 1479 bp  1312    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  88.04 
 
 		 1479 bp  1467    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  98.23 
 
 		 1465 bp  2698    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  99.39 
 
 		 1465 bp  2833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  99.86 
 
 		 1465 bp  2888    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  97.36 
 
 		 1401 bp  2484    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  97.36 
 
 		 1401 bp  2484    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 1478 bp  1423    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1477 bp  1429    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  86.47 
 
 		 1479 bp  1312    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 1479 bp  1320    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1474 bp  1618    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1479 bp  1475    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1479 bp  1475    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1477 bp  1429    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1477 bp  1429    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  98.21 
 
 		 1394 bp  2565    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.23 
 
 		 1488 bp  1497    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.23 
 
 		 1490 bp  1497    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.23 
 
 		 1488 bp  1497    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.23 
 
 		 1490 bp  1497    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  96.89 
 
 		 1479 bp  2559    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  96.84 
 
 		 1458 bp  2518    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  96.53 
 
 		 1440 bp  2450    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  96.53 
 
 		 1440 bp  2450    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  98.36 
 
 		 1465 bp  2714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  99.73 
 
 		 1465 bp  2872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1490 bp  1836    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1490 bp  1836    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1474 bp  1618    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  87.58 
 
 		 1482 bp  1423    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  87.58 
 
 		 1482 bp  1423    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  88.11 
 
 		 1479 bp  1475    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1498 bp  2970    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0076  16S ribosomal RNA  80.49 
 
 		 1476 bp  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0051  16S ribosomal RNA  80.49 
 
 		 1476 bp  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  0.139607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1555 bp  581  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1587 bp  575  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1556 bp  573  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1587 bp  575  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1587 bp  575  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0044  16S ribosomal RNA  80.42 
 
 		 1476 bp  571  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418237  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1587 bp  567  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0029  16S ribosomal RNA  80.78 
 
 		 1476 bp  567  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392184  hitchhiker  0.00162521 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1587 bp  567  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1587 bp  567  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0013  16S ribosomal RNA  80.35 
 
 		 1476 bp  563  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0073  16S ribosomal RNA  80.35 
 
 		 1476 bp  563  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0620583  hitchhiker  0.00094865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1612 bp  559  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 1612 bp  543  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 1612 bp  543  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 1612 bp  543  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 1612 bp  543  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1521 bp  545  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1521 bp  545  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  81.7 
 
 		 1501 bp  537  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  81.7 
 
 		 1501 bp  537  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  81.7 
 
 		 1501 bp  537  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1521 bp  537  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1521 bp  537  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  535  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  535  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1545 bp  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 		 1526 bp  531  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  82.36 
 
 		 1544 bp  525  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1545 bp  525  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1562 bp  521  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1510 bp  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  81.91 
 
 		 1510 bp  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  82.27 
 
 		 1544 bp  517  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1509 bp  513  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5671  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1509 bp  513  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000020932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0302  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1509 bp  513  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000398573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1507 bp  513  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>