82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4590 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  100 
 
 		 54 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  72.55 
 
 		 60 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  72.55 
 
 		 60 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  72.55 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 57 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  76.47 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  62.75 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  58.93 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  72.55 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  58.93 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  72.55 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  62.75 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  60.78 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  50.98 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  60.78 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  70.59 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  54 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  49.12 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  49.12 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  48 
 
 		 52 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 49 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 49 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  44.44 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  41.51 
 
 		 54 aa  43.5  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  46.3 
 
 		 49 aa  43.5  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  48.15 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  48 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 		 52 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 		 52 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 50 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 51 aa  40  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 		 49 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 50 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  42.31 
 
 		 59 aa  40  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  44 
 
 		 56 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>