117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0948 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  100 
 
 
80 aa  159  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02446  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.35 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0221  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.5 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.918434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.9 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0615  molybdopterin converting factor, small subunit  37.18 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0708  thiamineS  34.18 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  41.98 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.25 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.51 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.21 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.04 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  43.37 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1587  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.68 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.75 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  43.37 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  43.68 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.24 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3579  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.18 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3589  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.18 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  35.06 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  42.17 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  39.24 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3621  molybdopterin converting factor subunit 1  37.5 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.954935  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
85 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3358  molybdopterin converting factor subunit 1  36.59 
 
 
88 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.617714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3322  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
88 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3272  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
88 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13354  moaD-moaE fusion protein moaX  34.88 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00273279  normal  0.249285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3572  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.25 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.74 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3195  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1427  thiamineS  42.17 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6402  thiamineS protein  42.17 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.71 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7061  thiamineS protein  42.17 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.5 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.59 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  34.52 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
217 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
217 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  32.5 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  33.75 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  38.55 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  33.75 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  33.75 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2057  molybdopterin synthase subunit MoaD / molybdopterin synthase subunit MoaE  33.33 
 
 
228 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  33.75 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1889  MoaD family protein  35 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141172 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.5 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  32.91 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.94 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  37.8 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  32.5 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.93 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  32.5 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  32.5 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.71 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.51 
 
 
83 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.71 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.71 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.56 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  33.75 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  33.75 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  33.75 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3672  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0201  MoaD family protein  31.03 
 
 
231 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.804529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.8 
 
 
83 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 
83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 
86 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  36.59 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1645  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1349  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.47 
 
 
76 aa  40.8  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.48 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  32.5 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  37.04 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>