19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0624 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  39.06 
 
 		 498 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.49 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  28.45 
 
 		 176 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.32 
 
 		 512 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  34.72 
 
 		 646 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.53 
 
 		 673 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  38.98 
 
 		 486 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  41.38 
 
 		 547 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  24.82 
 
 		 192 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  34.92 
 
 		 579 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  28.17 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  32.86 
 
 		 549 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  28.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  32.32 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  32.95 
 
 		 501 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  41.51 
 
 		 558 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 550 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>