47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0286 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0286  patatin  100 
 
 		 536 aa  1099    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.55 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  27.59 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  26.46 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  27.32 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  29.11 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  24.91 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 875 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  31.6 
 
 		 981 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  23.23 
 
 		 746 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  26.94 
 
 		 346 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.32 
 
 		 760 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  29.11 
 
 		 317 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  26.37 
 
 		 357 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  30.95 
 
 		 894 aa  50.4  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  29.38 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  26.52 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  29.95 
 
 		 923 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  25.91 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  26.94 
 
 		 321 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  29.37 
 
 		 347 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  23.83 
 
 		 266 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.74 
 
 		 250 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  26.89 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  26.89 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  26.81 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  26.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  28.57 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.24 
 
 		 707 aa  47.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  27.8 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  25.1 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  27.03 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  28.37 
 
 		 332 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  30.2 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  29.15 
 
 		 339 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  28.07 
 
 		 346 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.6 
 
 		 379 aa  43.9  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.1 
 
 		 733 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  27.07 
 
 		 359 aa  43.5  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.23 
 
 		 740 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>