30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2649 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  74.14 
 
 
124 aa  147  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  73.28 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  43.36 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  43.24 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  57.14 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  47.25 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  44.94 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  58.82 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  58.82 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  57.45 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  45.56 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  40.18 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  43.27 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  44.94 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  26.89 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  36.8 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  50.57 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  60.53 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  68.75 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  46.51 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  43.82 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  30.51 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  30.83 
 
 
129 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0355  hypothetical protein  33.96 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000016256  hitchhiker  0.000400939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  35 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>