15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0663 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0663  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  275  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.380884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  28.45 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  25.86 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  27.12 
 
 
180 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0092  hypothetical protein  31.25 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  30.83 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  28.81 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  29.66 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  29.91 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  21.19 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3090  hypothetical protein  35.34 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.631584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  24.14 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  23.28 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  22.41 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0337  hypothetical protein  27.84 
 
 
149 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>