42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1442 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  100 
 
 
422 aa  869    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  45.28 
 
 
417 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  33.25 
 
 
411 aa  240  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  33.09 
 
 
411 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  29.45 
 
 
422 aa  196  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  31.08 
 
 
411 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  31 
 
 
388 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  29.44 
 
 
426 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  29.31 
 
 
417 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
414 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
414 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  28.24 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  28.24 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  26.54 
 
 
417 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  27.51 
 
 
419 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  27.51 
 
 
419 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  24.83 
 
 
436 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  26.88 
 
 
416 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  26.88 
 
 
416 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  24.29 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  25.35 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  23.13 
 
 
406 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  24.94 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  23.08 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  21.09 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  21.09 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.44 
 
 
366 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  25.45 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  21.68 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  21.68 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  20.25 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.66 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.31 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  23.51 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.28 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.59 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  25.11 
 
 
347 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  34.34 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  23.63 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  18.5 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  22.94 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  24.77 
 
 
383 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>