47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1177 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  100 
 
 
536 aa  1055    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  31.86 
 
 
534 aa  272  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  29.08 
 
 
500 aa  183  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  25.98 
 
 
550 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.89 
 
 
534 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.93 
 
 
531 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.54 
 
 
532 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  27.37 
 
 
555 aa  157  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  24.68 
 
 
565 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  25.27 
 
 
566 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  24.13 
 
 
529 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  24.36 
 
 
652 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  23.63 
 
 
530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  25.1 
 
 
527 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  24.77 
 
 
551 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  23.02 
 
 
561 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.71 
 
 
526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  25.6 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  24.21 
 
 
551 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  22.64 
 
 
552 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  23.69 
 
 
552 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  25.81 
 
 
549 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  23.86 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  23.86 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  23.86 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  24.7 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  27.1 
 
 
533 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  27.15 
 
 
496 aa  90.9  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  23.59 
 
 
539 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  21.74 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  23.83 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  22.72 
 
 
555 aa  84  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.71 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  23.39 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  22.91 
 
 
548 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  23.96 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  24.18 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  24.62 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  23.3 
 
 
542 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  23.86 
 
 
542 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  23.86 
 
 
542 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  23.31 
 
 
527 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  27.36 
 
 
533 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.19 
 
 
265 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  23.63 
 
 
527 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  26.2 
 
 
544 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  23.24 
 
 
546 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>