46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2898 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2898  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0208203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  48.57 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  51.72 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  51.92 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  44.07 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  48.15 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  40.74 
 
 		 504 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  37.7 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  42.11 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  39.71 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  42.86 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  38.89 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  44.23 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  43.4 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  44.23 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  33.01 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  41.07 
 
 		 115 aa  42  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  36.11 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 523 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 296 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  32.04 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  40.32 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  41.38 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  41.43 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  36.23 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  37.29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  29.09 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  39.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  42.62 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  31.03 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  31.03 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  31.03 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>