14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2536 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  100 
 
 		 146 aa  289  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  88.64 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  40.58 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  38.35 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  36.05 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  30.23 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  36.07 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  34.59 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  39.47 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  30.87 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  26.95 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  33.9 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  32.06 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  36.47 
 
 		 156 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>