30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0968 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  100 
 
 
514 aa  1056    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  87.18 
 
 
515 aa  895    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  37.62 
 
 
496 aa  316  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  28.8 
 
 
493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  30.02 
 
 
506 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  30.4 
 
 
503 aa  113  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  29.1 
 
 
536 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  29.1 
 
 
536 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  29.35 
 
 
534 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  27.3 
 
 
548 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  29.31 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  29.31 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  24.81 
 
 
300 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  41.03 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  25.51 
 
 
971 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  26.95 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  27.42 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  27.19 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  28.49 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  26.7 
 
 
874 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  43.1 
 
 
343 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  25.41 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  28.41 
 
 
412 aa  53.9  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00231  conserved hypothetical protein: N-acetyl-6-hydroxytryptophan oxidase (Eurofung)  24.91 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263931 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  23.79 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  22.61 
 
 
850 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  29.82 
 
 
542 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  23.94 
 
 
546 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  25.57 
 
 
904 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  36.76 
 
 
666 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>