More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4552 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  72.62 
 
 		 529 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  73.92 
 
 		 528 aa  771    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  73.07 
 
 		 532 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  66.23 
 
 		 533 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  71.02 
 
 		 549 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  67.23 
 
 		 531 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  71.1 
 
 		 542 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4613  carboxyl transferase  65.66 
 
 		 539 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.898276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  65.66 
 
 		 533 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.7 
 
 		 532 aa  762    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  71.92 
 
 		 530 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3201  carboxyl transferase  64.91 
 
 		 533 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  71.92 
 
 		 530 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  74.76 
 
 		 527 aa  799    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2828  carboxyl transferase  65.22 
 
 		 529 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  71.37 
 
 		 532 aa  778    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4552  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 534 aa  1091    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3263  carboxyl transferase  64.91 
 
 		 533 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  71.92 
 
 		 530 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0346  carboxyl transferase  61.47 
 
 		 532 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  58.57 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  57.49 
 
 		 554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  51.29 
 
 		 547 aa  524  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  52.04 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  50.56 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  49.91 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  50 
 
 		 554 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  49.72 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  48.88 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  48.42 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  51.3 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  49.63 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  48.51 
 
 		 536 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  49.17 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  51.11 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  50.19 
 
 		 536 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  48.35 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 536 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  49.17 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  48.32 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 534 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  48.61 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  48.61 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  48.89 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  49.63 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  48.89 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  48.89 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.48 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  48.6 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  48.79 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  49.35 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  48.7 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  47.59 
 
 		 534 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  48.7 
 
 		 535 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  48.7 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  48.15 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  48.52 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  48.9 
 
 		 540 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  48.79 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  49.07 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  50.28 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  48.33 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  47.96 
 
 		 547 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  49.07 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  49.07 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  48.7 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  48.6 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  47.98 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  48.88 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  48.04 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  47.12 
 
 		 534 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  46.94 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.77 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  48.6 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  48.79 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  48.51 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  48.77 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  47.92 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.96 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  47.1 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  48.23 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  46.92 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  48.42 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  47.04 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  47.67 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>