29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3815 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  38.52 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  38.38 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  38.18 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  38.54 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3955  peptidoglycan-binding LysM  41.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.574188  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  38.96 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.21 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.02 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2158  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184147  hitchhiker  0.00465889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2215  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0523981  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2169  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  33.64 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2442  peptidoglycan-binding LysM  37.21 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  44.21 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.883536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 149 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.13 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1692  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000329213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1809  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.66 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0414722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>