54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3234 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0842  hypothetical protein  52.04 
 
 		 377 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0960  hypothetical protein  53.41 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11250  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein  49.83 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.818521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  41.46 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  30.11 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  27.86 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  30.73 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  27.23 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  26.63 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  28.24 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  27.81 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  29.15 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  28.5 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  27.1 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  27.98 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  26.29 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  29.28 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  28.7 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  30.68 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  28.88 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  28.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  28.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  28.34 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  28.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  30.28 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  29.15 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  28.84 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  27.1 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  27.42 
 
 		 252 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  26.04 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  27.6 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  27.42 
 
 		 252 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  27.44 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  26.35 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  28.35 
 
 		 218 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  27.23 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  25.14 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  28.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  29.38 
 
 		 279 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  25.97 
 
 		 241 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  28.37 
 
 		 264 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>