31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1723 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  46.27 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  53.7 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  50.91 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  53.85 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  58.33 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  45.28 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  45.1 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  41.07 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  53.66 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  43.4 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  40.85 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 251 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  42.86 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  32.73 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  35.09 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 88 aa  40.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  33.8 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  43.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  34.43 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  45.1 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>