56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1680 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  68.99 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  67.44 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  62.02 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  61.24 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  56.8 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  54.4 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  53.12 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  56.59 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  54.47 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  52.71 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  52 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  50.41 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  48.78 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  44.72 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.59 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  39.34 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  44.44 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.23 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.23 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.25 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  40.79 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.77 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  29.75 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2000  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  33.6 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  25.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.61 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  38.03 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  32.79 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  31.15 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.33 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  32.58 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.69 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1716  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.79 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307308  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0015  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  30.69 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3494  queuosine biosynthesis protein QueD  32.5 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.1 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1351  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.03 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1973  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  28.16 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1339  queuosine biosynthesis protein QueD  30.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1898  queuosine biosynthesis protein QueD  28.16 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4052  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1437  queuosine biosynthesis protein QueD  30.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0192  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.83 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2514  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.17 
 
 		 138 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0457713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.74 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2504  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.72 
 
 		 290 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00731978  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0414  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  30.12 
 
 		 127 aa  40.8  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0704  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.53 
 
 		 275 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.926222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1354  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.72 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0598  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.86 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3789  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2756  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.02 
 
 		 118 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  30.11 
 
 		 123 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>