47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1666 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  100 
 
 		 548 aa  1036    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  42.41 
 
 		 652 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  42.44 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  42.04 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  38.5 
 
 		 561 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.66 
 
 		 529 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  40.89 
 
 		 533 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  37.47 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.3 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  37.01 
 
 		 552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  35.66 
 
 		 552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.2 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  34.9 
 
 		 550 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  36.62 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.48 
 
 		 545 aa  200  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  28.81 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  36.5 
 
 		 528 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  33.57 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  32.91 
 
 		 565 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  28.26 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  35.29 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.61 
 
 		 532 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.53 
 
 		 526 aa  183  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.48 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  33.64 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.92 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.39 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.19 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  32.48 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.34 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.34 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  31.89 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.57 
 
 		 534 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.07 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.01 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  24.25 
 
 		 500 aa  127  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  28.99 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  36.2 
 
 		 544 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  29.26 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  34.5 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  23.44 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.05 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.34 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.34 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  26.15 
 
 		 546 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  34.48 
 
 		 270 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>