More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2117 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>