56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0677 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  263  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  50.82 
 
 
137 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  44.03 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  36.29 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  38.76 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  43.7 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  41.12 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  36.75 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  39.6 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  28.95 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  43.7 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  38.98 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  38.98 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  35.38 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  32.06 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  46.67 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  26.9 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  39.56 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  42.7 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  39.36 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  33.64 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  33.64 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  37.35 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  43.9 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  35.87 
 
 
119 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  34.15 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  35.14 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  40.24 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  26.61 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  27.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  31.82 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  29.73 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  30.69 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  32.47 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  34.23 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  29.55 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  37.66 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>