20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2639 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  72.56 
 
 
270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  61.34 
 
 
263 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  57.26 
 
 
258 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  54.58 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  54.89 
 
 
257 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  52.21 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  27.59 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  32.59 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  29.46 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  20.99 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.39 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  27.33 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  27.78 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  26.32 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  25.95 
 
 
370 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00669  hypothetical protein  24.18 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0714  hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.703561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>