23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2527 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1545    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  29.76 
 
 		 820 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  28.94 
 
 		 751 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  25 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  31.72 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  25.55 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  31.18 
 
 		 689 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  25.57 
 
 		 833 aa  80.5  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  26.89 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  29.3 
 
 		 846 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  22.68 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  38.82 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  32.9 
 
 		 289 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5170  hypothetical protein  25.65 
 
 		 401 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196201  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  26.4 
 
 		 920 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  36.36 
 
 		 290 aa  54.3  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  39.05 
 
 		 955 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.07 
 
 		 289 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.41 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.33 
 
 		 283 aa  52.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  22.39 
 
 		 444 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  33.62 
 
 		 485 aa  47.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.08 
 
 		 746 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>