37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0062 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 90 bp  93.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  87.06 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  86.15 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0088  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632299  hitchhiker  0.00150076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0011  tRNA-Ser  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.213585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0059  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0162637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0053  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503093  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>