33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3916 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  50.96 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
202 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  35.89 
 
 
201 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.71 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  30.73 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  23.96 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.99 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  22.69 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  22.94 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
156 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  37.66 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  30.62 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.5 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  26.92 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  27.65 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  29.17 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07374  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_8G05690)  26.6 
 
 
210 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4223  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>