48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3675 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  100 
 
 		 532 aa  1013    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  45.11 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  39.85 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  38.27 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  38.02 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  31.02 
 
 		 534 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  37.27 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  37.52 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  38.38 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  38.38 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  38.38 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  42.5 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  38.64 
 
 		 555 aa  267  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  39.44 
 
 		 652 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  39.8 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  33.15 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  39.7 
 
 		 541 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  36.31 
 
 		 561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  39.59 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  38.86 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.64 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.39 
 
 		 534 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  39.44 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  37.14 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.53 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  36.63 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  35.93 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.67 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.58 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  36.52 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  35.47 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  35.93 
 
 		 528 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  35.42 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  24.54 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  32.02 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.04 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  25.11 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  32.4 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.84 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  29.72 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  33.85 
 
 		 544 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  29.08 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.49 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.49 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.49 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.48 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  35.59 
 
 		 143 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  33.7 
 
 		 270 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>