19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3421 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 83 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  48.75 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  47.54 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  47.46 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  36.71 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  41.56 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  36.51 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  36.51 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  39.74 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  33.75 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  35.9 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>