52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2859 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
219 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  47.52 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  37.33 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  39.53 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  37.84 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  31.58 
 
 
271 aa  72  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  37.23 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  40.91 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  34.23 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  34.23 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  28.12 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  34.86 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  40.38 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  28.32 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  29.77 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  32.03 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  30.2 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  35.71 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  32.26 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  27.63 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32.26 
 
 
228 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  40.26 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  37.93 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  30.39 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  33.67 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  40.74 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  44.44 
 
 
366 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  32.11 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  38.82 
 
 
336 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  47.22 
 
 
355 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  36.08 
 
 
307 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  58.82 
 
 
364 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  58.82 
 
 
364 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  40.28 
 
 
413 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  58.82 
 
 
364 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  41.18 
 
 
420 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  41.18 
 
 
420 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  60 
 
 
326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  55.88 
 
 
386 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  60 
 
 
326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  60 
 
 
326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  60 
 
 
326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  31.07 
 
 
282 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 
398 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  39.73 
 
 
364 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  60 
 
 
364 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>