46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1680 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  100 
 
 		 544 aa  1021    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  38.42 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.4 
 
 		 529 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.89 
 
 		 652 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  32.77 
 
 		 566 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  34.59 
 
 		 552 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  36.36 
 
 		 552 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  34.2 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.58 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  33.95 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  34.83 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.08 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.87 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  32.67 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  33.4 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  33.64 
 
 		 532 aa  157  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  33.15 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  32.71 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  34.41 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.01 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  27.24 
 
 		 555 aa  133  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.41 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  31.71 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.44 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  32.09 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  29.76 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.73 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  36.34 
 
 		 548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  31.11 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.31 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.31 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.31 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  29.31 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  33.42 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.97 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  29.94 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  31.74 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.27 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  22.06 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  25.76 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  33.11 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.38 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.57 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.57 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  37.31 
 
 		 270 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>