56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0003 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 83 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  96.39 
 
 		 86 bp  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 86 bp  133  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  94.94 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  94.94 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  92.77 
 
 		 83 bp  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  92.77 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  91.57 
 
 		 83 bp  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 86 bp  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 84 bp  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 87 bp  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 84 bp  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 84 bp  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0003  tRNA-Leu  92.21 
 
 		 83 bp  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  95.08 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0003  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 83 bp  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 83 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0063  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>